En el año 2009, la humanidad descubre una gigantesca nave espacial de origen extraterrestre que ha permanecido oculta durante años. Tras reconstruirla y bautizarla como SDF-1 Macross, la nave se convierte en el objetivo de una raza alienígena de gigantescos guerreros, los Zentraedi, que llegan a la Tierra para recuperarla. Cuando comienza el ataque, el Macross se ve obligado a despegar llevando consigo a miles de civiles, entre ellos el joven piloto Hikaru Ichijyo y la cantante Lynn Minmay. A partir de entonces, deberán sobrevivir a una guerra que llevará el conflicto hasta los confines del espacio.

Pero el enfrentamiento entre humanos y Zentraedi esconde un misterio mucho más profundo: una antigua cultura perdida, una tecnología capaz de cambiar el destino de la humanidad y el extraordinario poder de la música para influir incluso en una especie alienígena creada para la guerra.

Macross combina batallas espaciales, robots transformables, romance y música en una historia sobre la guerra, la supervivencia y el primer contacto entre dos civilizaciones.