La pacífica vida de Hayato con sus padres y su perro, se ve alterada cuando la ciudad es devastada por una nave fantasma, provocando una matanza en la que también pierde la vida sus padres. Antes de morir, este le rebela que él no es realmente su hijo. Hayato está ahora solo, luchando en un mundo nuevo y extraño trás el desatre. Su única meta será descubrir quien está detrás de las fuerzas misteriosas y lograr vencerlas.